近年来,环状寡核苷酸凭借其独特的闭环结构和卓越的生物稳定性,逐渐成为生物医学领域的研究热点。这类分子主要包括环状RNA(circRNA)和环状单链 DNA(CssDNA),在疾病诊断和治疗中展现出广阔的应用前景,正推动精准医疗迈向新高度。

环状寡核苷酸为何备受瞩目

环状寡核苷酸(Circular Oligonucleotide,cOligo)是一种闭合环状结构的短链核苷酸分子。与线性寡核苷酸不同,环状寡核苷酸没有自由的 5' 或 3' 端,而是通过化学连接或酶促催化形成共价闭合结构。这种环状结构赋予其更高的稳定性,对核酸外切酶的降解具有更强的抗性(Kool, 1996)。此外,其闭合结构赋予更高的构象灵活性,使其在分子识别和功能设计中更具优势(Chaturvedi & Vuković, 2019)。例如,环状 RNA 在细胞内可稳定存在长达24小时,远超线性RNA的4-7小时(Enuka et al., 2016)。

环状RNA(circRNA):精准医疗的“多面手”

环状RNA(circRNA)作为 RNA 家族的明星成员,是一类具有共价闭合环状结构的 RNA 分子,具有高稳定性、抗核酸酶降解的特性,在基因调控、疾病诊断和治疗中展现出重要潜力。


(Source: Cai J, et al. 2024)

1、疫苗开发:利用circRNA 编码抗原蛋白,并通过脂质纳米颗粒封装后注射到体内。circRNA 进入细胞后翻译出相应的抗原蛋白,最终由抗原递呈细胞(APC)呈递,引发免疫应答。

2、基因表达调控合成具有特定功能的 circRNA,例如 miRNA 海绵、蛋白海绵、基因沉默等。通过纳米颗粒递送到靶细胞后,这些 circRNA 可在细胞内执行相应的基因调控功能。

3、细胞治疗:利用circRNA 编码 CAR(嵌合抗原受体)或 TCR(T 细胞受体)结构蛋白,并封装于靶向纳米颗粒中。通过静脉注射,可直接在体内原位生成 CAR-T 或 TCR-T 细胞,无需复杂的体外病毒改造过程,能够显著提高开发效率、降低开发成本。

4、其他应用circRNA 具备蛋白翻译潜力,可用于表达特定蛋白,例如肿瘤免疫调控细胞因子、高强度结构蛋白(例如蛛丝蛋白),以及 PROTAC 复合物(用于降解特定蛋白)等。

此外,circRNA 可通过 RNA 编辑(ADAR 介导)和 RNA 干扰(RISC 复合体),实现更复杂的基因功能调控,为药物研发开辟了全新路径。

环状单链DNA(CssDNA):基因治疗的未来之钥

作为一种长盛不衰的核酸形式,CssDNA 为基因治疗和生物医学研究带来了全新的视角。这一古老分子在现代生物医学研究中焕发出全新活力,凭借其优势成为下一代精准医疗的核心驱动力。


(Source: Cai Cao X, et al. 2024)

1、环状DNA 适配体筛选环状 DNA 适配体具有较强的核酸酶抗性、热稳定性和结合亲和力,最新研究实现了从环状 DNA 文库中筛选适配体,并开发了用于靶向递送的双特异性环状适配体。

2、基于CssDNA 的滚环扩增(RCA)生成DNAzymeRCA 利用环状 DNA 模板生成长单链产物进行信号放大,并可结合适配体和 DNAzyme 构建复杂纳米结构,广泛应用于基因治疗。

3、miRNA海绵(miRNA Sponge)基于 CssDNA 的 DNA 海绵相比 RNA 海绵更稳定、更高效,能够有效抑制致癌 miRNA,促进肿瘤抑制基因的表达以实现抗肿瘤作用。

环状单链 DNA(CssDNA)因其稳定性高、可扩增性强,成为基因调控、核酸酶合成和适配体筛选等领域的重要工具。

合成能力升级,助力寡核苷酸合成研究与应用

赛索飞生物凭借十余年寡核苷酸合成经验积累,成功突破技术壁垒,研发出化学合成 circRNA 与 CssDNA 工艺,实现高纯度、高稳定性、精准修饰的环状 DNA 和 RNA,并与我们成熟的体外转录(IVT)circRNA 技术相结合,为科研和产业化应用带来全新选择,满足您不同长度、纯度等多样化的研究需求。

案例分析:成功合成 80nt 环状 DNA(CssDNA)


图1. 经质谱检测,成环前后目的分子量相差约为 37,符合实验设计预期的线性化 DNA 成环的特征。该项目线性化 DNA 环化过程中脱去 2 个水分子,预计成环后分子量减少~36。


图2. 利用线性 DNA 消化酶验证 DNA 成环效果。同等实验条件下,经线性消化酶处理后,线性 DNA 片段被消化,而环状 DNA 无显著变化。

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作为全球领先的 DNA、RNA、基因、蛋白合成技术合作伙伴,赛索飞生物凭借多年的技术沉淀,持续赋能基因治疗、RNA 疫苗与精准医疗的前沿突破。此次成功开发化学方法合成环状 DNA 和 RNA,标志着公司在核酸药物开发领域迈入“环状时代”,同时也为生物医药和生命科研研究注入全新动能。

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